課題4.マルチプルアライメント(CLUSTALW)

ヒト、マウス、チキンの BCL-2、ヒトの BCL-X、ヒトの BCL-W の5本のアミノ酸配列で、CLUSTAL-W を用いてマルチプアライメントを作成し、保存されている残基を調べる。

手順

  1. DBGET で SwissProt に対してキーワード検索を行い、上記5つの配列を集める。
  2. あるいは課題3にあるように、ヒトの BCL-2 で SwissProt に対してホモロジー検索を行い、必要な配列を集めてもよい。
  3. ブラウザの新しいウインドウに CLUSTALW を開く。
  4. SwissProt エントリーの SQ リンクから、それぞれの fasta 形式のアミノ酸配列を取得し、それをコピーして順次 CLUSTALW のページのボックスにペーストする。
  5. 5本の配列が入力できたら、Exec ボタンを押して実行する。

URL のリスト

CLUSTALW
GenomeNet: http://clustalw.genome.ad.jp/


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Last updated: June 19, 2000