課題９．ゲノム比較解析（KEGG）

手順

1. KEGG のゲノムマップの項目から、Identify gene clusters in two genomes を開く。
2. 比較したい生物種（例：Mycoplasma genitalium と Mycoplasma pneumoniae）を選択する。
3. Exec ボタンを押して実行する。

4. ゲノム比較の全体像は、Genome map comparison (Java) で調べることができる。
5. 比較したい生物種（例：Mycoplasma genitalium と Mycoplasma pneumoniae）を選択し、Cluster search をチェックする。
6. Exec ボタンを押して実行する。
7. ホモロジ─の高い遺伝子が同じようなオペロン構造で並んでいる領域には対 角線上にドットが並んで表示される。

8. 進化的に離れた生物種間保存されている遺伝子の並びはオペロンなどの機能的単位である場合が多く、KEGG ではオーソロググループテーブルとしてまとめられている。例えば、tryptophan operon のオーソログテーブルを調べてみよ。

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