バイオインフォマティクス入門コース
理論分子生物学(京都大学理学部)講義資料
- ゲノム解析とポストゲノム解析
(参考資料)ヒューマンゲノム計画とニューバイオフィジックス
- データベース技術とインターネット
(参考資料)ゲノムネットのデータベースサービス概要
- 分子生物学データベース
(課題1)データベース検索(DBGET/LinkDB, PubMed)
(課題2)タンパク質立体構造グラフィックス(RasMol, Chime)
- 配列アライメントとホモロジー検索
(課題3)ホモロジー検索(FASTA, BLAST)
(課題4)マルチプルアライメント(CLUSTALW)
(資料)式一覧
- 構造予測と機能予測
(課題5)モチーフ検索(MOTIF, PFAM)
(課題6)タンパク質二次構造予測、膜貫通部位予測(nnpredict, SOSUI)
(課題7)タンパク質立体構造分類(SCOP, CATH)
- ネットワーク比較とパス計算
(課題8)パスウェイ解析(KEGG)
(課題9)ゲノム比較解析(KEGG)
(課題10)反応経路計算(KEGG)
問題集
ゲノムネット利用法
参考図書
チュートリアル
原著論文リスト
Last updated: March 24, 2001
Minoru Kanehisa